| Posgrado | División | Plan de estudio | Sitio web |
| Maestría en Ciencias (Física)** | CBI |  | Ir a sitio |
| Maestría en Ciencias (Matemáticas)** | CBI | | Ir a sitio |
| Maestría en Ciencias (Ingeniería Química)** | CBI | | Ir a sitio |
| Maestría en Ciencias (Ingeniería Biomédica)** | CBI | | Ir a sitio |
| Maestría en Ciencias (Química)** | CBI | | Ir a sitio |
| Maestría en Ciencias (Matemáticas Aplicadas e Industriales)** | CBI | | Ir a sitio |
| Maestría en Ciencias y Tecnologías de la Información** | CBI | | Ir a sitio |
| Maestría en Energía y Medio Ambiente** | CBI | | Ir a sitio |
| Maestría en Biotecnología** | CBS | | Ir a sitio |
| Maestría en Biología Experimental** | CBS | | Ir a sitio |
| Maestría en Biología** | CBS | | Ir a sitio |
| Maestría en Biología de la Reproducción Animal** | CBS | | Ir a sitio |
| Maestría en Energía y Medio Ambiente** | CBS | | Ir a sitio |
| Maestría en Ciencias Económicas** | CSH | | Ir a sitio |
| Maestría en Estudios Sociales** | CSH | | Ir a sitio |
| Maestría en Ciencias Antropológicas** | CSH | | Ir a sitio |
| Maestría en Estudios Organizacionales** | CSH | | Ir a sitio |
| Maestría en Humanidades** | CSH | | Ir a sitio |
| Maestría en Psicología Social | CSH | | Ir a sitio |
| Posgrado Integral en Ciencias Administrativas | CSH | | Ir a sitio |
| ** Mastrias que cuentan con Beca-CONACyT | Divisiones: |
| Para mayor información de Becas-CONACyT contactar al coordinador del programa de posgrado. | CBI: División de Ciencias Básicas e Ingeniería CBS: División de Ciencias Biológicas y de la Salud CSH: División de Ciencias Sociales y Humanidades |